Introdução: As doenças autoimunes, como a Artrite Reumatoide (AR), desafiam a prática clínica por seus efeitos sistêmicos e repercussões sobre a saúde bucal. Apesar das evidências que relacionam inflamação sistêmica e alterações orais, a investigação odontológica criteriosa é crucial. Objetivo: Descrever a aplicação de um protocolo sistemático voltado para a avaliação odontológica de pacientes com AR. Método: Trata-se de uma pesquisa científica que visa contribuir para a prevenção, o diagnóstico precoce e o manejo de agravos orais insidiosos, frequentemente negligenciados em abordagens convencionais. O protocolo adotado envolveu etapas estruturadas, incluindo anamnese médica detalhada, exame odontológico padronizado e coleta de saliva estimulada e não estimulada e fluido crevicular gengival, com foco na caracterização do perfil odontológico. O estudo foi aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa sob o CAAE: 85435317.8.0000.5147. A análise integrou dados clínicos e laboratoriais, relacionando achados locais a parâmetros sistêmicos da AR, como capacidade funcional e atividade inflamatória. Resultado: Foi evidenciado uma alta prevalência de periodontite crônica e gengivite ativa associada ao aumento do fluido crevicular, queixas de xerostomia, diminuição do fluxo salivar, alteração do pH salivar e alto índice de perda dentária. Conclusão: Os dados revelam que apesar dos pacientes relatarem queixas odontológicas alterações bucais foram que observadas podem afetar potencialmente a doença reumatológica e seu tratamento médico, destacando a importância da atuação interdisciplinar e da vigilância odontológica contínua na prática reumatológica para o cuidado integral de pacientes.