O objetivo deste estudo foi avaliar o alinhamento dos forames supra- orbitais, infra-orbitais e mentuais em relação à linha média de acordo com o sexo e o lado em uma amostra de crânios da população brasileira por análise morfométrica em 3D. Um total de 116 tomografias computadorizadas de adultos, crânios e mandíbulas humanos secos, foram selecionados aleatoriamente na faixa etária de 19 a 100 anos (57,31), ambos os sexos. As medidas foram realizadas no software Rhinoceros 5 a partir do plano sagital mediano referenciado. Os resultados foram submetidos ao teste de normalidade de Shapiro-Wilk, seguido pelo teste t pareado de Student ou Wilcoxon, para verificar se há diferenças em relação aos lados direito e esquerdo; para verificar se há diferenças entre os resultados contínuos do mesmo lado, o teste de normalidade de Shapiro-Wilk foi realizado e seguido pelo teste ANOVA One-Way ou Kruskal-Wallis. Para corrigir o valor de p para múltiplas comparações, os testes post-hoc de comparações múltiplas de Tukey ou Dunn também foram realizados para ANOVA de uma via e teste de Kruskal-Wallis, respectivamente. Os níveis de significância e confiança foram estabelecidos, respectivamente, em 5% e 95%. Quando comparados os forames supraorbital, infraorbital e mentual do mesmo lado, ocorreu um resultado estatisticamente significante para todas as comparações de ambos os lados em relação aos indivíduos do sexo masculino e feminino (p <0,0001). Exceto para medidas que envolvem forame supraorbital-forame mentual, todos os resultados mostraram um resultado estatisticamente significativo para comparações entre os lados direito e esquerdo dos indivíduos. O presente trabalho mostrou que não houve alinhamento dos forames.