Os micoplasmas possuem grande importância em pacientes imunocomprometidos e são responsáveis por infecções respiratórias graves e inflamações persistentes, como as que ocorrem em pacientes HIV-positivos. Com base nesses aspectos, o objetivo deste trabalho foi identificar microrganismos da classe Mollicutes em indivíduos HIV-positivos com diferentes condições bucais e imunológicas. Para tanto, 118 indivíduos foram selecionados, em tratamento ou não com medicações antirretrovirais (ARV). Amostras de biofilme supra e subgengival foram coletadas, bem como os registros médicos dos pacientes. A detecção da classe Mollicutes foi realizada pela técnica da reação em cadeia da polimerase (PCR), utilizando-se iniciadores e temperaturas específicas para os microrganismos alvos. As inter-relações entre a significância dos parâmetros clínicos e microbiológicos foram determinadas por regressão logística multivariada. Os resultados mostraram que nos pacientes baixo número de células CD4+ a prevalência desses microrganismos era significativamente mais elevada, tanto no biofilme supra quanto subgengival. E a maior ocorrência dessas bactérias foi em pacientes HIV-positivos que não empregavam os esquemas de múltiplas drogas antirretrovirais. Com base nesses resultados, concluiu-se que a classe Mollicutes pode ser um bom indicador da condição imunológica e da viremia em pacientes HIV-positivos.