Durante compactação vertical da guta-percha aquecida, os cimentos endodônticos absorvem o calor gerado no interior do canal. O objetivo deste estudo foi avaliar a influência de diferentes cimentos na dissipação do calor produzido pelo System B em raízes humanas e determinar as alterações induzidas pelo calor na composição, propriedades físico-químicas e mecânicas dos cimentos. Caninos humanos foram instrumentados e preenchidos com os cimentos endodônticos AH Plus, Pulp Canal Sealer, MTA Fillapex ou experimental à base de Portland (CE). System B foi ativado no interior dos canais e a dissipação foi avaliada na superficie radicular nos diferentes terços (apical, médio e cervical) sob diferentes condições de umidade (ar, HBSS e gel de HBSS) utilizando termopares. Alterações na composição química, tempo de presa (TP) e resistência à compressão (RC) dos cimentos induzidas pelo calor foram investigadas. Nos terços médio e cervical, o tipo de cimento não interferiu no aumento de temperatura na superfície radicular (p > 0,05). As condições de umidade interferiram na dissipação de calor nos terços cervical e médio, sendo que os maiores aumentos de temperatura foram verificados em ar (60°C). Altas temperaturas levaram à redução no TP do AH Plus e do CE (p < 0,05) produzindo diminuição na RC do AH Plus e aumento na RC do CE (p < 0.001). A composição química do cimento AH Plus alterou-se após ser submetido à altas temperaturas. Pode-se concluir que as condições de umidade influenciaram na dissipação do calor gerado pelo System B e as propriedades físico-químicas e mecânicas do cimento AH Plus foram negativamente afetadas pelo aumento de temperatura.