Avaliou-se o efeito do uso de dentifrícios com clorexidina em pacientes ortodônticos, em relação à gengivite, sangramento gengival, manchamento extrínseco do esmalte e tártaro. Dividiram-se os pacientes igual e aleatoriamente em três grupos: A(1100 ppm F(NaF)), B(1100 ppm F(NaF) e 0,50% de clorexidina) e dentifrício C(1100 ppm F(NaF) e 0,75% de clorexidina). Examinaram-se os voluntários antes do início da escovação e nos intervalos de 6 e 12 semanas. Avaliou-se os efeitos dos dentifrícios utilizando-se os testes ANOVA e Kruskal-Wallis. Os índices de gengivite e sangramento melhoraram em todos os grupos, mas após 12 semanas os dentifrícios contendo clorexidina demonstraram desempenho melhor. Apenas o dentifrício contendo 0,75% de clorexidina demonstrou aumento significante do manchamento extrínseco do esmalte (P = 0,0005), embora a maioria dos pacientes não percebeu as alterações. O índice de tártaro diminuiu nos três grupos, mas os grupos A (P ≤ 0,0001) e B (P = 0,0037) demonstraram melhora significante. Concluímos que o uso de dentifrícios contendo clorexidina é efetivo no tratamento da gengivite em pacientes ortodônticos, especialmente os dentifrícios contendo 0,50% de clorexidina, os quais não provocaram manchamento extrínseco do esmalte significante.