As doenças imunomediadas despertam interesse na Odontologia por suas manifestações bucais onde sua etiologia não está totalmente esclarecida. Além dos mecanismos imunopatológicos o uso de medicamentos pode estar relacionado. As doenças com manifestação bucal mais prevalentes na população são o líquen plano (LP), o pênfigo vulgar (PV), o penfigóide cicatricial (PC) e o eritema multiforme (EM). Neste estudo analisamos as de manifestações bucais de doenças imunomediadas e a associação com medicamentos e doenças sistêmicas. Foram avaliados prontuários dos pacientes atendidos no Serviço de Medicina Bucal – FOAr - UNESP (período de 2001 a 2004), com diagnóstico de doença imunomediada (LP, PV, PC e EM). Foram coletados: características demográficas, hábitos, doenças sistêmicas, medicamentos e aspectos clínicos das lesões. O Programa Epi-Info permitiu análises estatísticas dos resultados. A freqüência de doenças imunomediadas encontrada foi: LP (87%), PC (6%), PV (3,5%) e EM (3,5%). 67% dos pacientes com LP apresentavam doenças sistêmicas e 55% faziam uso de medicamentos. Em concordância com a literatura e com base nos resultados encontrados, o uso de certos medicamentos parece estar relacionado à presença de doenças imunomediadas com lesões bucais.