O preenchimento adequado de todos os dados de identificação da criança, o diagnóstico, plano e evolução do tratamento, assim como autorizações, exames complementares, atestados, receitas e recibos devem ser arquivados no prontuário do paciente. Para se alcançar rapidamente o correto diagnóstico e plano de tratamento, o exame clínico deve ser realizado de forma detalhada e cuidadosa, não se esquecendo de se observar o paciente como um todo. O Odontopediatra tem o objetivo de diagnosticar, prevenir e tratar problemas de saúde bucal, além de interagir com outros profissionais da área de saúde como médicos, fonoaudiólogos, nutricionistas, entre outros. Desta forma, para um bom relacionamento inter-disciplinar ele deve estar sempre bem embasado e suportado para poder indicar e interagir com esses profissionais. Um prontuário completo e detalhado facilitará na busca de informações que esses outros profissionais necessitarem. Neste trabalho discute-se a importância da organização e preservação do prontuário na Clínica Odontopediátrica, revela algumas características clínicas pertinentes a crianças e apresenta um protocolo básico de orientação sobre os exames físico, clínico e radiográfico, visando o atendimento e o diagnóstico precoce.